1、合法性原则
依法办事是政府采购工作的首要准则，也是制定政府采购内部控制制度应遵守的首要原则。政府采购内部控制制度建设应当严格遵守《政府采购法》、《招标投标法》等相关法律法规的规定，以免扰乱政府采购市场经济秩序。
2、适应性原则
政府采购内控制度的建设应当符合我国实际，与政府采购的特点和要求相适应，只有如此才能使政府采购内部控制制度适应政府采购管理要求并发挥作用。
3、规范性原则
政府采购内控制度应当对政府采购的各项工作进行全面规范，使政府采购工作严格按照规章制度有序进行。即政府采购的每个过程、部门、环节，包括单位内部、单位与单位都要相互牵制；既要事中控制，还要实施事前和事后控制等。
4、科学性原则
政府采购内控制度的建设要符合科学性的原则，即制度既要有科学合理的可操作性，又要使其符合并体现政府采购活动中诸如采购方式、评标方法的科学性，不能违背相关的会计、统计、管理学科的基本方法和要求。
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