医学研究的基本程序是指一项研究课题从开始到终止所经过的步骤。大体经过选题、申请、实施、总结、鉴定、报奖及推广转化等几个基本程序。科研经常性管理必须围绕着基本程序进行，保证研究工作顺利开展、达到出成果、出人才、出效益的目的。科研经常性管理包括计划管理、成果管理、经费管理、人才培养、科技档案、学术交流等。
医学科研计划管理的内容
医院根据发展目标、方针和政策，结合医院的实际情况，发挥优势和特点，制订相应的科研规划和计划。医院的科研规划和计划应参照国家和地方的规划和计划精神，根据防病治病原则，结合医院实际情况加以制订。除了制订相应的科技规划和计划外，还要把计划管理的重点放到课题计划上。
主要抓好科研课题的选题、开题论证、同行评议、督促检查、组织协调、及时申报，核心是抓科研课题设计。课题计划管理由两部分内容组成：立题管理和实施管理。课题计划管理的具体内容主要包括选题、申请、实施和总结等。
一、选题方面，要把握好“度”
选择课题就是选择确定自己的主要研究方向，它决定着整个科研工作的价值和成败。爱因斯坦曾说：“提出一个问题往往比解决一个问题更重要，因为解决问题也许仅仅是一个数字或技术上的技能而已，而提出新的问题、新的可能性，从新的角度去看旧的问题却需要创造性的想象力，而且标志着科学的真正进步。”因此，科学地选择课题，是科学研究中具有战略意义的首要问题。
（1）选题原则
科学性原则：要符合客观规律，有一定的理论和实践依据。
目的性原则：必须以学科发展为目的，与学科主攻方向相一致。
创新性原则：创新应是前人没有研究过的或是已有研究工作上的再创造，包括新发现、新设想、新见解，也可以是新理论、新技术、新方法或开拓的新领域，要防止低水平的重复。
竞争性原则：注重对跨学科、跨系统联合攻关的管理研究，形成独具医院特色的科学研究发展方向，提升竞争力。
（2）选题注意事项
选题必须明确主攻方向，具备科学性和创新性，体现受试对象、处理因素、效应结果三要素。通过查新，摸清该科研领域内国内外的研究现状，包含技术方法和手段、发展趋势等，以判断所选课题研究价值。
选题后要先对课题研究方案进行可行性分析，以确定可以的设计是否周密、方法是否科学、路线是否合理以及技术是否先进可行。
准备好开题报告，接受同行考核评议，以审定该课题是否具备立题条件。
二、课题申请，要讲“规范”
（1）申请书的撰写
确定选题后，如何将自己的研究思路充分表达出来，使同行专家和主管部门认可便成为关键。能否写出一份高质量的申请书，不仅体现了研究者的学术水平，也是申请课题竞争性强弱的关键。主要内容包括：立论论据、研究方案、研究基础、经费预算及来源的。
（2）课题质量控制
医院应强化创新意识，把握学科前沿，努力提高申请课题的质量和总体水平，主要内容包括：管理部门把好形式审查关，学术委员会把好学术水平质量关和上报审批。
三、课题实施，要讲“实效”
课题实施管理是指在选定课题后，管理者和负责人在职责范围内对课题实施过程中各种基本要素进行有效的协调控制和综合平衡，以实现课题的一系列活动。
（1）落实计划，明确职责
课题负责人对课题的完成负有全责，要认真对好课题的组织，指挥、协调工作，严格掌握课题进度，合理安排经费使用，负责对课题进行小结、总结和汇报以及组内人员的指导与考核，建立一套组内共同遵守的规章制度，以保证研究工作有条不紊地开展。医院科研管理部门是课题完成的保证单位，应负责监督、检查课题履行情况及课题的验收工作，并协调解决课题执行过程中出现的各种矛盾与纠纷。
（2）定期检查、掌握进度
为全面掌握课题执行情况，必须建立研究工作检查制度。检查的目的在于及时了解情况，及时发现问题和解决问题，这是保证科研计划顺利进行的有效手段。对课题计划的执行情况进行检查，内容包括计划实施、条件落实、经费使用情况以及遇到的困难等，以便及时协调解决。
（3）按期结题、及时总结与验收
课题按规定时间结束后3个月内，管理部门应督促课题负责人认真撰写出科研课题结题报告。报告内容包括结题简表（研究概况）、研究内容及研究简要经过，取得的主要成果及意义，达到的主要技术经济指标，对研究成果的评价和建议，完成论文论著目标和经费使用决算等。
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